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新冠病毒蛋白结构模型资源库面世

科技 2020-06-05 00:00:00

来源:科技日报   责任编辑:李琦

  据物理学家组织网近日报道,一个国际结构生物学家团队对新冠病毒所包含蛋白质结构进行研究,并在此基础上创建了一个名为“Web”的资源库。该资源库还包括对现有新冠病毒蛋白结构模型的评估等资源,可以帮助科学家更好地了解新冠病毒,促进新冠肺炎药物和疫苗的研发工作。

  了解新冠病毒蛋白质的结构对于开发新冠肺炎疗法和疫苗至关重要。最新研究负责人、美国弗吉尼亚大学结构生物学家瓦勒德克・迈耶尔说:“我们仔细分析了现有新冠病毒蛋白模型,并给出了结果,旨在帮助生物医学界。结构模型是其他科学家对病毒蛋白理解的体现,有时并不那么优异,因此,验证重要结构非常关键。大多数情况下,我们只提出了较小的修正建议。但在某些情况下,修正意义重大,特别是在蛋白质―配体复合物领域,这对于药物研发等后续研究至关重要。”

  当新冠病毒席卷全球时,全世界科学家以前所未有的速度做出反应,确定病毒的原子结构及其蛋白质的组成,并为此构建出了各种新冠病毒蛋白质的结构模型。

  研究人员正在各种应用中使用这些结构模型,从基于结构的药物设计到规划一系列生物医学实验等。因此,这些原子模型必须尽可能准确。由于新冠肺炎大流行病来势汹汹,在发表和同行评审之前,这些结构大多数都存放在“蛋白质数据库”(PDB)中,这是一个大分子结构的全球数据存储库。

  迈耶尔所在团队的成员都是结构验证和解释领域的专家,他们注意到可以使用最新方法改进几种新冠病毒模型,正是在此动机的驱使下,他们创建了新的Web资源库。该资源库与PDB同步,每周更新一次,以确保该资源库包含的模型都是最准确的模型。

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